Après avoir échappé à Stainman, un Mjölnir ennemi du Tartaris, du Dimitrius et leurs équipages, les deux sous-marins doivent prendre la fuite face à deux sous-marins de la Flotte Internationale.
2015, une Troisième Guerre Mondiale (aussi appelée Grande Guerre Globale) est déclenchée. Plus tard, en 2030, le Monde est ravagé par une terrible Guerre Nucléaire qui rasa la surface de la planète et les survivants de l'holocauste se sont réfugiés dans les profondeurs des Océans. Soul Religion raconte l'histoire de l'équipage du Tartaris, un sous-marin toute dernière génération chargé du maintien de la paix dans l'Atlantique et de ses découvertes sur les événements passés.
Après avoir échappé à Stainman, un Mjölnir ennemi du Tartaris, du Dimitrius et leurs équipages, les deux sous-marins doivent prendre la fuite face à deux sous-marins de la Flotte Internationale.